怀孕不可以艾灸肚子，尤其孕期前三个月。怀孕时胎儿刚好位于腹部的位置，艾灸肚子亦引起胎动，子宫产生宫缩可能导致先兆流产。孕妇可选择远端的穴位，如四肢的穴位进行艾灸治疗疾病，如出现胃疼、恶心、呕吐等症状时，可艾灸足三里、内关等穴位。

艾灸本身含有挥发油，亦产生较浓烈的气味，孕妇常待在艾灸馆里或经常使用艾灸，长时间嗅到这种气味易产生不利影响，但可偶尔进行艾灸。艾灸为一种良好的保健治疗方法，但在某些特殊时期及特殊的部位，需避免使用，可能造成不良影响。